Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf12Q61286 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf12Q61286 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcf12Q61286 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcf12Q61286 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcf12Q61286 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcf12Q61286 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcf12Q61286 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcf12Q61286 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcf12Q61286 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf12Q61286 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tcf12Q61286 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf12Q61286 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf12Q61286 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf12Q61286 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf12Q61286 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf12Q61286 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms