Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf235Q61116 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znf235Q61116 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf235Q61116 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf235Q61116 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms