Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift20Q61025 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift20Q61025 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift20Q61025 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms