Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf3Q60980 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klf3Q60980 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klf3Q60980 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms