Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp7Q60973 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp7Q60973 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.3 ms