Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf4Q60793 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf4Q60793 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf4Q60793 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms