Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctf1Q60753 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms