Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csnk2a1Q60737 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csnk2a1Q60737 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms