Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Samhd1Q60710 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Samhd1Q60710 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Samhd1Q60710 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms