Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q5XFZ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q5XFZ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q5XFZ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q5XFZ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q5XFZ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q5XFZ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q5XFZ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q5XFZ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q5XFZ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q5XFZ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms