Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf15Q5UBV8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf15Q5UBV8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms