Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mks1Q5SW45 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mks1Q5SW45 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mks1Q5SW45 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms