Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam71bQ5STT6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam71bQ5STT6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms