Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Utp18Q5SSI6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Utp18Q5SSI6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Utp18Q5SSI6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Utp18Q5SSI6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms