Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms