Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RilpQ5ND29 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RilpQ5ND29 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms