Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vmn1r209Q5NC97 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r209Q5NC97 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r209Q5NC97 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms