Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata48Q5NC83 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Spata48Q5NC83 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata48Q5NC83 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata48Q5NC83 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata48Q5NC83 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata48Q5NC83 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata48Q5NC83 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata48Q5NC83 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata48Q5NC83 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata48Q5NC83 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms