Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vps41Q5KU39 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps41Q5KU39 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps41Q5KU39 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms