Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBH1

Rassf5, Ras association domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf5Q5EBH1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf5Q5EBH1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf5Q5EBH1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms