Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc8bQ5DU41 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc8bQ5DU41 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms