Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eri2Q5BKS4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eri2Q5BKS4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eri2Q5BKS4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms