Protein–RNA interactions for Protein: Q59IW6

Abi3bp, ABI gene family, member 3 (NESH)-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abi3bpQ59IW6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abi3bpQ59IW6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abi3bpQ59IW6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abi3bpQ59IW6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms