Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmtc2Q56A06 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmtc2Q56A06 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.9 ms