Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Eme2Q56A04 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms