Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CenpjQ569L8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CenpjQ569L8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CenpjQ569L8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms