Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm14685Q52KH6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm14685Q52KH6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm14685Q52KH6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms