Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc84Q4VA36 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc84Q4VA36 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms