Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx49Q4FZF3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddx49Q4FZF3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx49Q4FZF3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms