Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Afg1lQ3V384 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Afg1lQ3V384 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Afg1lQ3V384 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms