Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SvipQ3UZP4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SvipQ3UZP4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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