Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm27235Q3UW50 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm27235Q3UW50 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm27235Q3UW50 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm27235Q3UW50 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm27235Q3UW50 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm27235Q3UW50 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm27235Q3UW50 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm27235Q3UW50 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm27235Q3UW50 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm27235Q3UW50 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm27235Q3UW50 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm27235Q3UW50 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm27235Q3UW50 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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