Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm29609Q3UU56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm29609Q3UU56 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms