Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chpf2Q3UU43 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chpf2Q3UU43 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chpf2Q3UU43 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms