Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
B3gnt6Q3USF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B3gnt6Q3USF0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B3gnt6Q3USF0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms