Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms