Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Washc4Q3UMB9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Washc4Q3UMB9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms