Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ceacam5Q3UKK2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ceacam5Q3UKK2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ceacam5Q3UKK2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms