Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc61Q3UJV1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc61Q3UJV1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc61Q3UJV1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.2 ms