Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Edc4Q3UJB9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Edc4Q3UJB9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Edc4Q3UJB9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Edc4Q3UJB9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Edc4Q3UJB9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Edc4Q3UJB9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Edc4Q3UJB9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Edc4Q3UJB9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Edc4Q3UJB9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Edc4Q3UJB9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Edc4Q3UJB9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Edc4Q3UJB9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Edc4Q3UJB9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms