Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mtcl1Q3UHU5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Mtcl1Q3UHU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mtcl1Q3UHU5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mtcl1Q3UHU5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mtcl1Q3UHU5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mtcl1Q3UHU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms