Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst1Q3UHN9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndst1Q3UHN9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst1Q3UHN9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms