Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam193bQ3U2K0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam193bQ3U2K0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam193bQ3U2K0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 341.2 ms