Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Serac1Q3U213 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serac1Q3U213 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms