Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pag1Q3U1F9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pag1Q3U1F9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pag1Q3U1F9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms