Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc9Q3U0M1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc9Q3U0M1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc9Q3U0M1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms