Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hhla1Q3TYV2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hhla1Q3TYV2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hhla1Q3TYV2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms