Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atp13a5Q3TYU2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp13a5Q3TYU2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp13a5Q3TYU2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms