Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc136Q3TVA9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc136Q3TVA9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms