Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTJ4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q3TTJ4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3TTJ4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms